L'initiative de créer l'Institut de philosophie Indépendant revient à Yulia Sineokaya, ancienne directrice adjointe pour la recherche et ancienne directrice du laboratoire d’histoire de la philosophie occidentale à l'Institut de philosophie de l'Académie des sciences de Russie. Résidant en France depuis février 2022, elle commence en automne de la même année à rétablir les liens entre les philosophes qui ont quitté la Russie en raison de leur désaccord avec l'agression militaire de la Russie contre l'Ukraine.

Le logo de l’association fait référence à son intitulé original «Fire exit» qui a été créé lors d'une rencontre entre Yulia Sineokaya et Alexander Dobrokhotov. Le 13 octobre 2022 a eu lieu la première réunion en ligne à laquelle 16 personnes ont participé. Depuis cette date, l’association organise des réunions hebdomadaires le samedi, au cours desquelles des exposés sont présentés et discutés et des questions liées au fonctionnement de l'association sont abordées. Le nombre de participants augmente à chaque rencontre, et au moment de l’enregistrement légal de l’association en mai 2023, elle comptait près de quarante membres. Conformément à la législation française, Yulia Sineokaya et Alexey Zhavoronkov sont des fondateurs officiels de l’association. Le 22 avril 2023 l’Assemblée générale constitutive réunissant 35 personnes a élu le Conseil d’administration de l’association : Yulia Sineokaya (présidente), Alexey Zhavoronkov (trésorier), Aleksandra Berdnikova (secrétaire). Le 9 mai 2023, la Préfecture de Paris a officiellement accepté la déclaration d’enregistrement de l’Institut Indépendant de Philosophie.